Para desabilitar o Ctrl+Alt+Del você vai precisar editar pelo terminal ou com um editor de texto qualquer do Linux um arquivo que esta na pasta /etc. O arquivo chama-se inittab.

Abra-o com um editor de sua preferência e procure por uma linha como essa:

# Trap CTRL-ALT-DELETE
ca::ctrlaltdel:/sbin/shutdown -t3 -r now

Para que não seja mais possível usar este artifício para reiniciar a máquina, comente a linha acima com um "#" no início da linha.