A dica é simples e direta. Como esconder a versão do Bind (DNS)? Para aqueles que gostam da segurança por obscuridade aí vai!

Colocar no arquivo de configuração do Bind, que geralmente fica em /etc/named.conf (distro SuSE), na seção "options":

options {
    ...
    version "adivinha?";
    ...
}

No caso, quando alguém perguntar a versão do meu DNS ele mostrará "adivinha?".