Garimpando na internet, encontrei um projeto no GitHub que visa facilitar (ou ficarmos mais preguiçosos) na instalação do GNS3 no Fedora.

Este projeto visa, como diz o título, instalar o GNS3 com apenas 3 comandos:

git clone https://github.com/lricardo/gns3-for-fedora.git
cd gns3-for-fedora
./aio-install.sh

Após, execute seu GNS3 e altere o caminho do VPCS, caso utilize deixando para: /opt/vpcs/src

Espero ter ajudado!
Att.

Fonte: GitHub - lricardo/gns3-for-fedora: GNS3 Installer Script for Fedora