A versão do MySQL 4.1 não está mais em fase de aprovação e já é recomendada pela MySQL AB.

Atualizei meu servidor MySQL 4.0 para o 4.1 sem nenhum problemas.

Essa versão contém importantes mudanças, como por exemplo, é mais rápida, mais flexível em comunicação client-server, novos recursos de instalação e configuração, maior segurança e suporte adicionado a caracteres internacionais, dentre outras coisas.

Lista completa de mudanças:

http://dev.mysql.com/doc/mysql/en/News-4.1.x.html

Download:

http://dev.mysql.com/downloads/mysql/4.1.html

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