Dê boot no CD ou DVD de instalação de Slackware Linux normal e escolha o tipo de teclado. Quando estiver como root, monte a partição onde está instalado o mesmo.

Crie um link no /etc do kernel que está bootado para o /etc do Slack que está instalado e rode o comando lilo normalmente.

Exemplo:

O Slack está no hda5, montaremos ele em /mnt:

# mount /dev/hda5 /mnt

Criamos o link em /etc

# cd /etc
# ln -s /mnt/etc/lilo.conf

ou:

# ln -s /mnt/etc/lilo.conf /etc

Então, o comando:

# lilo

Foi testado em Slackware 12 e 12.2. Claro, existem maneiras mais simples de se fazer isso.