É possível fazer uma limpeza no hd com linux? [RESOLVIDO]

Bom gente trabalho com manutenção de PCs e na maioria com windows, mas eu uso linux e frequentemente acontece que HDs dao problemas aqui na assistência e no windows msm formatando em modo lento NTFS nao consigo fazer o HD funcionar, mas assim que formato ele com linux EXT3 so pra testar ja resolve o problema.
Gostaria de saber se a formatação EXT3 faz alguma "limpeza" no hd ou se isto é só uma coincidência?

Não, faz limpeza, a diferença de ext3 para o ntfs, está na melhor utilização de superblocks e do journaling mais eficiente, o que torna pouco necessário a utilização de desfragmentação do ext3.

Mas fora isso não há nenhuma forma de limpeza como no estilo de formatação física...