Basicamente, quando usamos o APTonCD, temos duas escolhas: "criar" ou "restaurar".

Podemos criar mídias para usar posteriormente, ou restaurar os pacotes gravados em uma mídia para o cache do apt. Note que na figura acima o programa está em português (eu estava usando o KUbuntu com KDE4). É isso mesmo: já há tradução para o nosso idioma. Na verdade, é o único idioma com tradução.

Após a tela acima vamos experimentar a opção "Criar" para criar uma mídia com nossos pacotes. Nós vemos agora os nossos pacotes disponíveis. Por padrão todos os pacotes são escolhidos, mas se você quiser pode desmarcar alguns. Para criar a mídia, clique no botão "Gravar". Nessa tela, escolha o tipo de mídia (CD ou DVD). Se o tamanho da ISO for maior que a capacidade da mídia escolhida, o programa automaticamente divide em várias ISOs. Escolha também o diretório onde a ISO será gravada e o nome da imagem.

Note também a opção "Criar um meta-pacote", marcada por padrão. Se ficar marcada, é criado um pacote com uma única função: instalar todos os pacotes da ISO que estamos construindo. É extremamente útil para facilmente re-instalarmos todos os pacotes em outra ocasião. Dessa forma, basta instalar o meta-pacote, e não cada pacote individualmente.

Após clicar em "Apply", começa a criação das ISOs.