A propriedade SUID é somente para arquivos executáveis e não tem efeito em diretórios.

Nas permissões básicas, o usuário que executou o programa é dono do processo. Mas em arquivo executável com a propriedade SUID aplicada, o programa rodará com o ID do dono do arquivo, não com o ID do usuário que executou o programa.

Normalmente o usuário dono do programa executável é também dono do processo sendo executado. Ou seja, quando um arquivo/programa executável tem o controle de acesso SUID, ele é executado como se ele estivesse iniciado pelo dono do arquivo/programa.

A permissão de acesso especial SUID pode aparecer somente no campo Dono.

Exemplo:
Um exemplo para arquivo executável com a propriedade SUID é o arquivo /usr/bin/passwd. Ou seja, quando executamos o comando passwd com qualquer usuário normal, o processo é executado com ID do usuário root (como se o usuário root tivesse executado o comando passwd), pois somente o usuário root tem permissão para alterar o arquivo /etc/passwd.

# ls -lah /usr/bin/passwd
-rwsr-xr-x 1 root root 27K 2006-04-03 10:37 /usr/bin/passwd

Comandos:

Aplicando SUID:

Aplicando a propriedade SUID em um arquivo executável utilizando formato simbólico (s):

# chmod u+s programa.sh
# ls -lah programa.sh
-rwsr-xr-x 1 root roberto 0 2006-09-26 22:57 programa.sh

Aplicando a propriedade SUID em um arquivo executável utilizando formato octal (4):

# chmod 4750 programa.sh
# ls -lah programa.sh
-rwsr-x--- 1 root roberto 0 2006-09-26 22:57 programa.sh

Retirando SUID:

# chmod u-s programa.sh
# ls -lah programa.sh
-rwxr-x--- 1 root roberto 0 2006-09-26 22:57 programa.sh

Procurando SUID:

Procurando a propriedade SUID em um arquivo executável utilizando formato simbólico (s):

# find /home/roberto -perm u=s
/home/roberto/programa.sh

Procurando a propriedade SUID em um arquivo executável utilizando formato octal (4):

# find /home/roberto -perm -4000
/home/roberto/programa.sh