Vou relatar a experiência que tive que talvez seja de ajuda para alguém que esteja passando pelo mesmo problema. Na verdade é bem simples...

Após instalar a nova versão do Ubuntu tive que instalar a versão mais nova da Watchtower Library. Como imagino que já saibam, esse programa possui versão apenas para Windows. Para as versões anteriores há várias instruções: configurações específicas para o Wine, instalação de fontes do windows, utilização do winetricks, etc. Até mesmo um script foi criado pelo nosso colega Hamacker Watchtower Library. Mas mesmo usando todas as dicas que haviam funcionado anteriormente: falhei. Não sabia se era a nova versão do Ubuntu ou a nova versão da Watchtower.

Tentei instalar a versão antiga da Watchtower (2009) para identificar se era o sistema ou o programa. E como consegui instalar a versão 2009, então concluí que não era com o Ubuntu. Indo direto ao ponto. Como resolvi?

Desinstalei as versões anteriores do Wine e instalei a mais recente (até então versão beta) 1.3.21. Pronto. Executei o instalador (Setup.exe) direto do cd (sem nenhuma preparação prévia como precisávamos anteriormente) e funcionou perfeitamente.

O que me ajudou foi o seguinte link:

• WineHQ - Watchtower Library 2010

Ali vi que a Watchtower 2010 já havia sido testada no Ubuntu 11.04 e funcionava. Então verifiquei que estava com a versão mais nova apenas do wine "estável". Instalei o beta e resolvido.

Quem dera ter achado aquele link antes!

Termino aqui meu relato e espero que essa dica ajude alguém que talvez esteja quebrando a cabeça pesquisando na net pra resolver um "problema" tão simples.