Aí galera! Depois de pesquisar muito na web encontrei uma solução para o problema que eu tive para adicionar comentários no Nagios. Qualquer comentário que eu tentava adicionar ao Nagios aparecia o erro:

Error: Could not stat() command file /var/lib/nagios3/rw/nagios.cmd

Segue então.

Parar o serviço nagios:

# /etc/init.d/nagios3 stop

Rodar os comandos:

# dpkg-statoverride --update --add nagios www-data 2710 /var/lib/nagios3/rw
# dpkg-statoverride --update --add nagios nagios 751 /var/lib/nagios3

Iniciar o Nagios:

# /etc/init.d/nagios3 start

Espero ter ajudado.

Abs.