Ler uma sequências fasta e separar por tamanho [Bioinformática]

cleysinhonv

O presente script lê um arquivo no formato fasta e separa por tamanhos < 9000; < 18000; >18000 em três arquivos diferentes. Como utilizar? 1) Após download é preciso alterar a permissão do arquivo: chmod +x get_by_length.pl 2) O script pode ser executado assim: ./get_by_length.pl arquivo.fasta ou perl get_by_length.pl arquivo.fasta O resultado será direcionado para três arquivos diferentes: arquivo.fasta_9000.fasta arquivo.fasta_9000_18000.fasta arquivo.fasta_18000_20504.fasta

Por: José Cleydson Ferreira da Silva

beepop - popups com o texto digitado

removido

Script inicialmente feito pelo z3bra, com algumas modificações minhas. Ele deve ser executado preferencialmente com .xinitrc, no seu servidor Xorg. Ele fica em background lendo texto que é enviado ao seu FIFO, se criar um symlink para o beepop com o nome de popup, você pode usar assim: $ popup teste 1 2 3 Se não quiser pode só dar echo no FIFO. $ echo teste 1 2 3 > "$XDG_RUNTIME_DIR"/beepop.fifo Note que XDG_RUNTIME_DIR/beepop.fifo é o caminho padrão, edite o script para mudar.

Por: Perfil removido

Raízes da equação de segundo grau (Bhaskara) através do prompt em shell

removido

Da série "scripts inúteis" ou "inutilitários". Este script recebe três números inteiros ou decimais via linha de comando, correspondentes a "a", "b" e "c", na equação de segundo grau ax²+bx+c=0 e retorna os dois valores para os quais x valida a equação, transformando a expressão em zero. Ele também fornece as raízes complexas conjugadas. Os valores são impressos na tela por uma linha cada totalizando duas linhas impressas. O script foi testado até onde pude contra possíveis bugs. Nada impede de haver algum. Exemplo de funcionamento $ ./bhaskara-0001.sh 1 2 1 -1.000000000000000 -1.000000000000000 Outro exemplo: $ ./bhaskara-0001.sh 1 2 3 -1.000000000000000 - 1.414213562373095i -1.000000000000000 + 1.414213562373095i Vejam a letra "i" ao final de cada linha, indicando a raiz complexa. Se tiver coragem, ainda pretendo fazê-lo funcionar para parâmetros complexos.

Por: Perfil removido

ISOsync_pt-BR.py - Um Baixador Automático de ISOs de Sabayon, escrito em Python

albfneto

Nova versão de Junho de 2017, corrigindo pequenos Bugs de Tradução e Código. Esta é uma adaptação (para servidores brasileiros) e tradução (para pt-BR) de um "Baixador" de ISOs, para baixar os Sabayon Linux atuais (Daily 17.05 e Monthly 17.03) de Junho de 2017. O arquivo é uma tradução, atualização (o original era para Sabayon 16) e modificação do arquivo original.escrito em Python (ISO Sync) por Wolfden, EUA. Ele é um dos desenvolvedores do Sabayon. Link do original: https://github.com/wolfden/Coding/blob/master/python%20files/iso_rsync#L1 Os servidores RSYNC (originais da Bélgica) foram substituídos pelos espelhos do RSYNC brasileiro, e os comandos de baixar foram modificados para funcionarem com os parâmetros brasileiros. Para ir atualizando este script, certifique-se de editar as linhas para adequar sempre para as mais recentes ISOs Monthly, veja aqui, quais... http://sabayon.c3sl.ufpr.br/stable/ Se não editar, não funcionará, somente para as Daily Builds. Testado em 13 de Junho de 2017, em Sabayon Linux 17.05. Baixa quaisquer "Daily Builds" e as estáveis, Montly, 17.03. Para rodar o script, execute: python ISOsync_pt-BR.py

Por: Alberto Federman Neto.

O que fazer após instalar o Debian 8 - versão em Shell Script

kelvinferraz

Este script tem a ideia de ajudar os usuários novatos e usuários inteligentes. Sua operação é simples e intuitiva. Usando apenas script em bash e a interface gráfica add-on "dialog". Críticas e sugestões são bem vindas! Lembrando: a intenção do script é ajudar o usuário básico ou até mesmo alguém que esteja com dificuldades para instalação de programas básicos. Espero que gostem!

Por: Kelvin Ferraz

copy - copiar para a área de transferência

removido

Copia para a área de trabalho (clipboard) os parâmetros enviados ao script ou os lê via STDIN. Exemplos: ./copy string ./copy <ENTER> this is a string <^d> ./copy < string ./copy < filepath

Por: Perfil removido

Instalação Zabbix-agent Debian8

AugustoRibeiro

O script realiza a instalação do Zabbix-Agent no Debian8, necessitando apenas de interação para informa o IP do servidor Zabbix e o hostname da máquina. Caso queira alterar a configuração do zabbix_agentd.conf altere da linha 35 a 48. Por padrão utilizo o repositório do zabbix-Agent 3.0 ( http://repo.zabbix.com/zabbix/3.0/debian/pool/main/z/zabbix-release/zabbix-release_3.0-1+jessie_all.deb ), caso queira alterar modifique a linha 24.

Por: Augusto Ribeiro

Baixador automático de Sabayon

albfneto

Este é um baixador automático de Sabayon. Ele localiza os mais recentes "Daily Builds" do Sabayon Linux, e os baixa, usando sincronização com rsync. Requer o pacote rsync instalado. Testado em Sabayon 17.05, mas como usa apenas rsync e comandos gerais, deve poder baixar Sabayon também a partir de outras distros. Baseado no script RSYNCdev, de Joost Ruis, Holanda,e divulgado por Patrick Tuithof, Holanda: https://www.facebook.com/groups/36125411841/10153865837371842/ https://plus.google.com/104450923229791580725/posts E é uma modificação melhorada do meu script anterior, RSYNCDEV-pt-BR: https://www.vivaolinux.com.br/script/rsyncdev-pt-BR-v6sh-Um-baixador-automatico-de-ISOs-de-Sabayon-Linux-versao-6

Por: Alberto Federman Neto.