Para formatar CNPJ com o sed, faça o seguinte:

CNPJ 18 caracteres (antigo):

echo 99888777000155 | sed -e 's!\.!!g;s!\(..\)!\1.!1;s!\(.\)!\1.!6;s!\(.\)!\1/!10;s!\(.\)!\1-!15'

A saída será: 99.888.777/0001-55

CNPJ 19 caracteres (novo):

echo 199888777000155 | sed -e 's!\.!!g;s!\(.\)!\1.!3;s!\(.\)!\1.!7;s!\(.\)!\1/!11;s!\(.\)!\1-!16'

A saída será: 199.888.777/0001-55

Bom trabalho a todos!